En 2047. Le capitaine Miller, aux commandes du vaisseau de sauvetage "Lewis et Clark", reçoit l'ordre d'embarquer le docteur Weir et de se rendre aux abords de Neptune. Weir révèle alors à l'équipage que l'"Event Horizon", qu'il avait lui-même conçu et qui est capable de créer ses propres trous noirs, disparu depuis sept ans, vient d'émettre un message pour le moins sibyllin. Ils parviennent à retrouver le vaisseau, y amarrent le "Lewis et Clark", et décident d'explorer l'épave. Celle-ci est vide, mais comporte de nombreuses traces de lutte sanglante. Le jeune Justin, avalé puis recraché par la sombre paroi liquide du noyau gravitationnel, endommage le "Lewis et Clark". L'équipage doit se replier sur l'"Event Horizon". Très vite, chacun est la proie d'horribles visions, faisant écho à ses plus intimes failles...